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综合| 发布时间 | 稿件数| 金额

￥0.00 基因突变的功能验证

易科... 274人浏览/4人投稿 6年前已托管赏金

已检测出某一基因突变，想要验证一下它的功能，包括生物信息学预测以及蛋白质的功能验证。请问可以帮忙做这方面的实验吗？

所属分类: 生物信息分析

任务已完成
￥10.00 求助crispr-cas9相关问题

ouxin 126人浏览/1人投稿 6年前已托管赏金

求助威客大神，刚刚开始了解crispr-cas9系统，关于gRNA连接有部分问题，想请教下大家。1.gRNA随便连接到一个表达载体就可以了吗，如pet28a，和我们表达蛋白的一样？2.还是直接连接到启动子之后，我看到许多文章连接到U6之后，U6之后往往有一段SD序列，是不是也加上。形成U6+SD+sgRNA。3.另外有些前段带有标签，直接加入sgRNA形成，酶切位点+标签+sgRNA，这样转录出来的sgRNA带有标签，会不会影响其作用的发挥。

所属分类: 生物信息分析

任务已完成
￥10.00 这种序列比对图是什么软件做出来的啊？有人知道吗？

chaoy... 94人浏览/2人投稿 6年前已托管赏金

这种序列比对图是什么软件做出来的啊？有人知道吗？

所属分类: 生物信息分析

任务已完成
￥10.00 审稿人提了这个问题

王飞 116人浏览/3人投稿 6年前已托管赏金

最近审稿人提了这个问题，我实在不知道如何下手，麻烦大家帮我看看，我在文中做了一个lncRNA－mRNA网络图。以下是问题：How do the co-ex pression network analyses presented in melanoma compare to those described in the Gencode project? https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12864-015-2307-5 Do the co-ex pressions in glioma differ from the Gencode predicted targets of the lncRNA selected.

所属分类: 生物信息分析

任务已完成
￥10.00 RNA-Seq测序

nieho... 171人浏览/2人投稿 5年前已托管赏金

在做RNA-Seq测序，但实验组与对照组相比并未筛出很多的基因，导致DEGs很少，go分析时发现p-value值都比较大，那么我这个该怎么分析，是不是这个时候p-value检测就不能继续用了或者有没有其他的办法。请教下各位威客大神！

所属分类: 生物信息分析

任务已完成
￥45.00 genespring使用

醉芳... 222人浏览/3人投稿 5年前已托管赏金

从geo下载数据后如何用genspring筛选差异基因，步骤及选用的参数

所属分类: 生物信息分析

任务已完成
￥20.00 RNA-seq问题

gangb 77人浏览/5人投稿 5年前已托管赏金

各位大神好，我最近在做一些RNA-seq数据，链特异性文库，在比对的时候也加了相应的参数。比对之后samtools转换成排序后的bam文件。用Stringtie进行拼接，加了-e参数，即不拼接新的转录本，以及注释文件（gtf）。得到结果后大多数数据看起来都还不错，但是线粒体部分出现了大部分基因表达量为0的问题。查了下Stringtie生成的e_data.ctab文件，可以看到这些基因对应的exon的read counts数都很高，有几万到几十万，怎么看它们的FPKM也不应该是0吧……所以我现在有两点不明白，第一是链特异性参数到底会对拼接产生什么影响？第二是我是否对线粒体部分操作有误，或者理解有误？感谢！

所属分类: 生物信息分析

任务已完成
￥10.00 请问大家用哪个软件可以做出这种火山图吗

yitin... 121人浏览/5人投稿 5年前已托管赏金

请问大家用哪个软件可以做出这种火山图?如何根据差异蛋白fold change来标记不同颜色呢？

所属分类: 生物信息分析

任务已完成
￥10.00 logistic回归的列线图

wenya... 105人浏览/2人投稿 5年前已托管赏金

最近分析数据需要用R做一个关于logistic回归的列线图，在网上和论坛里找了很多代码，套用总是出错。数据很简单就是糖尿病，高血压是二分类，其余是定量资料，代码如下：library(foreign)rt=read.table("senlintu.txt",header=T);rtlibrary(Hmisc); library(grid); library(lattice);library(Formula); library(ggplot2)library(rms)rt=data.fr ame(rt)DM HBP dd=datadist(rt)options(datadist="dd")f1 summary(f1)f2 nom 在生成nom时总是提示：Error in lims[[i]] : subsc ript out of boundsIn addition: Warning message:In structure(limits, class = "data.fr ame", row.names = c("Low:effect", : Calling 'structure(NULL, *)' is deprecated, as NULL cannot have attributes. Consider 'structure(list(), *)' instead.另外很奇怪的是有时出现这份错误后还是可以做出列线图，但是在图中也会把没有统计学意义的变量放进去，非常奇怪。

所属分类: 生物信息分析

任务已完成
￥10.00 刚接触生物信息学，在处理数据时候发现一个问题

qinya... 179人浏览/2人投稿 5年前已托管赏金

刚接触生物信息学，在处理数据时候发现一个问题：在Affymetrix主页下载注释文件HG_U133A时候，预览文件可以见到探针ID、基因名称等项目，但是下载Affymetrix human gene 1.0 ST的注释文件后，预览文件项目中没有见到基因名称一栏（Affymetrix human gene 2.0 ST注释文件也没有发现基因名称一项）。请各位前辈指点迷津，谢谢啦！

所属分类: 生物信息分析

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