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单人悬赏 请问如何根据GEO平台基因注释文件提取lncRNA
已托管赏金:

10.00

  • 发布需求,托管赏金 2018.04.19
  • 威客投稿
  • 雇主选稿
  • 中标公示 2018.05.09
  • 验收付款 2018.05.09
  • 评价 2018.11.08

任务描述

请问怎么从GEO数据库获取的GPL基因注释文件中提取lncRNA的部分呢?尝试从GENCODE网站下载全部lncRNA的信息用ensembl号进行对应,但能筛选出的lncRNA很少且不全,请问各位大神,有什么其他办法能筛选出lncRNA呢?还是利用ensembl号对应有什么需要注意的地方呢,万分感谢!!

从GENCODE下载的lncRNA信息

GEO数据库中平台的基因注释信息

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